Com a criação do Mestrado em Energias Sustentáveis, o ISEP pretende dar resposta à crescente necessidade do tecido económico e social de profissionais competentes e especializados para atuar nos domínios da produção de energias sustentáveis, sua distribuição e gestão, ao nível dos grandes investimentos de produção de energia baseados em fontes renováveis (eólica, marés, hídrica, geotérmica), assim como ao nível da produção de média e pequena escala, industrial ou doméstica (microgeração, co-geração), racionalização de consumos e na gestão ambiental das empresas modernas.